Osobną sprawą jest konieczność magazynowania wytworzonej przez elektrownię wiatrową energii. Spowodowane jest to tym, że generatory prądu pracują średnio na poziomie 25% zainstalowanej mocy, a ich czas pracy wynosi przeciętnie 5000 h/rok. Aby więc móc w sposób ciągły korzystać z energii wytworzonej przez EWi, zwłaszcza wtedy gdy siłownia nie pracuje, niezbędne okazuje się magazynowanie energii.
Najczęściej stosuje się w tym celu akumulatory, jednak trzeba się wtedy liczyć z tym, że zmagazynować można ograniczoną ilość energii, a dodatkowo mamy do czynienia z pewnymi stratami pozyskanej energii.
Dość często stosowanym sposobem jest wykorzystywanie nadprodukcji energii do elektrolizy wody, w wyniku czego wytwarza się wodór. Posłuży on następnie do napędzania turbiny w bezwietrzne dni lub przy zbyt porywistych wiatrach, które uniemożliwiają i bezpieczną pracę wiatraka. Jest to rozwiązanie hybrydowe i jest zazwyczaj związane z dowolnym nośnikiem energii, który zapewnia stabilną pracę elektrowni wiatrowej.
Kolejnym hybrydowym rozwiązaniem, stosowanym w przypadku gdy wykorzystuje się energię wiatru bezpośrednio w celach grzewczych, jest odprowadzanie energii cieplnej do gruntu i magazynowanie jej w ten sposób. Odzyskiwanie tej energii umożliwiają pompy ciepła.